삼천불전은 석가여래를 본존으로 모시고 있다. 중앙 벽면 앞 불단에 봉안된 〈석가여래삼존상〉은 본존 석가여래 좌, 우에 문수·보현보살 좌상을 협시로 하였다. 본존 석가여래는 편단우견의 착의(着衣)법에 항마촉지인을 취하였고, 좌, 우 협시보살은 각각 화려한 겹보관을 쓰고 한 손에 연꽃가지를 들고 있다. 이 〈석가여래삼존상〉 후불벽에는 〈영산회상도〉가 걸려 있는데, 석가·문수·보현의 삼존을 중심으로 10대보살, 신장상, 10대 제자, 팔부중 등의 성중이 모여 있는 모습을 화려한 채색과 금선으로 묘사하였다. 본존을 모신 중앙 벽면은 소형의 보살좌상으로 가득 채워져 있는데, 우측 벽면에는 두건을 쓰고 석장을 든 〈지장보살좌상〉을, 좌측 벽면에는 화불이 있는 보관을 쓴 〈관음보살좌상〉을 배치하였다. 또한 전각 내에는 성덕대왕신종을 모본(模本)으로 제작한 서운암 동종이 있다. 한편, 삼천불전의 〈석가여래삼존상〉과 〈지장보살좌상〉, 〈관음보살좌상〉의 ‘삼천불전 삼존불 및 원불·불감 점안 대법회’가 2023년 10월 8일 봉행되었다.