『묘법연화경삼매참법』의 권별 구성과 과목은 다음과 같다.
| 권차 | 과목 | 품제 |
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| 상권 상권 보기 |
1. 여섯 가지 상서에 대한 문답[六瑞問答] | 서품(序品) |
| 2. 법설주(法說周) | 방편품(⽅便品) | |
| 3. 비유주(譬喩周) | 비유품(比喩品) 신해품(信解品) 약초유품(藥草喩品) 수기품(授記品) |
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| 4. 인연주(因緣周) | 화성유품(化城喩品) | |
| 중권 중권 보기 |
5. 삼주의 설법을 듣고 성불하리라 수기받음[聞三周說法受記作佛] | 오백제자수기품(五百弟⼦授記品) 수학무학인기품(授學無學人記品) |
| 6. 범성이 경전의 덕이 광대함을 널리 찬탄함[凡聖弘賛廣大] | 법사품(法師品) 견보탑품(⾒寶塔品) 제바달다품(提婆達多品) 지품(持品) |
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| 7. 천행의 보살이 악세에 경을 설함[淺⾏菩薩惡世說經] | 안락행품(安樂⾏品) | |
| 8. 적불을 열어 본불을 드러내고, 성불의 기별을 줌[開迹顯本授成佛記] | 종지용출품(從地涌出品) 여래수량품(如來壽量品) 분별공덕품(分別功德品) |
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| 하권 하권 보기 |
9. 고금에 널리 유통됨과 부처님의 부촉[古今弘通并佛付囑] | 수희공덕품(隨喜功德品) 법사공덕품(法師功德品) 상불경보살품(常不輕菩薩品) 여래신력품(如來神⼒品) 촉루품(囑累品) |
| 10. 중생을 교화하는 스승은 법을 위해 몸을 잊음[化他之師爲法忘身] | 약왕보살본사품(藥王菩薩本事品) | |
| 11. 다른 세계의 보살들이 명을 받들어 경전을 홍포함[他⽅大⼠奉命弘經] | 묘음보살품(妙⾳菩薩品) 관세음보살품(觀世⾳菩薩品) |
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| 12. 악세에 경전 유통을 옹호함[惡世擁護流通] | 다라니품(陀羅尼品) 묘장엄왕본사품(妙莊嚴王本事品) 보현보살권발품(普賢菩薩勸發品) |




