보문산 마애여래좌상은 보문산 시루봉 북동쪽 자락에 위치한다. 마애불은 ‘장수바위’라 불리는 바위에 새겨져 있으며, ‘장수부처’라는 별칭으로 불리기도 한다. 마애불은 높이 약 6m인 바위의 남쪽면에 얕은 부조로 조성되어 있다. 독존의 여래좌상으로, 광배를 지니고 있으며 전체 높이는 322㎝이다. 마애불은 얼굴과 삼도까지는 1~1.5㎝ 정도 두께로 도드라져 있지만, 그 아래로 내려갈수록 조각 깊이가 얕아지며 하부는 양각선과 음각선으로 처리하였다. 머리는 나발이며 육계가 높고 넓게 솟아 있다. 얼굴은 긴 타원형에 가까우며, 반개하고 있는 눈은 눈꼬리가 치켜 올라가 있다. 상호에서 인상적인 것은 명확한 인중과 꾹 다물고 있는 입술 모양이다. 위, 아래로 ‘M’자형을 이룬 입술은 윤곽이 명료하며, 양 입꼬리 끝을 오목하게 파서 입모양을 강조하였다. 대의는 양 어깨를 덮고 있으며, 열린 가슴에 완만한 곡선을 이루는 내의 자락이 드러나 있다. 옷주름은 직선적이고 도식화된 모습이지만, 양각선으로 묘사한 다리 부분은 마치 필선으로 그린 듯 가늘고 자연스러운 굴곡을 이룬다. 수인은 명확하게 보이지 않지만, 오른손을 어깨 부근까지 들고 왼손은 명치 부근까지 들어 손가락을 구부린 모양이다. 결가부좌한 무릎 위로 오른발이 노출되어 있는데, 발가락의 윤곽과 발금까지 세밀하게 묘사되었다. 광배는 한 줄의 테두리를 지닌 정원형의 두광과 신광으로 구성되어 있다. 대좌는 확인되지 않는다. 대전 보문산 마애여래좌상은 얕고 저부조와 음각선, 양각선 등의 제작 방식이 뛰어난 기술로 구사되어 있다. 불상의 상호와 착의법, 광배 등은 고려 후기 불화에 나타나는 요소들과 유사성을 보인다. 이러한 회화적 성격을 띤 제작 방식과 회화를 모본으로 한 듯한 도상 표현은 고려 후기 마애불의 경향 중 하나로서, 이 상에는 이러한 시대적 특징이 잘 반영되어 있다.