2003년 수덕사 대웅전(大雄殿)에 봉안되어 있는 목조삼존여래좌상의 개금(改金)을 하는 과정에서 복장이 발견되어 조사가 이루어졌다. 복장유물은 조성발원문을 비롯한 전적류와 복식류, 다라니로 싼 후령통, 청색 보자기로 싸여 있던 사리·칠보, 흰색 보자기 2장으로 싸여 있던 여러 종류의 직물 조각·실꾸리, 녹색 보자기로 싸여 있던 곡식 등이다. 조성발원문 통해 1639년 조각승 수연이 전북 남원의 풍국사에서 세 분의 부처님상을 조성하였음을 알 수 있다. 1980년대 개금 당시 중앙의 석가여래좌상에만 복장기를 봉안했을 뿐 다른 복장물을 봉안하지 않았던 것으로 보아 삼존여래좌상의 복장은 1639년 조성했을 당시의 처음 상태를 2003년까지 유지하고 있었던 것으로 추측된다. 아미타여래좌상의 복장유물 전체와 석가여래좌상과 약사여래좌상의 복장유물은 훼손 상태가 심각한 전적류와 표지류만 수습하여 수덕사 근역성보관으로 이운했다.

석가여래좌상, 약사여래좌상, 아미타여래좌상에서 각각의 불상 조성발원문을 확인할 수 있었는데 숭정 12년(1636년, 인조 17)년에 석가여래좌상과 약사여래좌상은 대웅전, 아미타여래좌상은 보광전에 새로 조성한다는 내용으로 아미타여래좌상의 발원문만 수덕사 근역성보관에 이운되어있다.

崇禎十二年歲次己卯秋冬兩節中萬行山豊國寺大雄殿 藥師尊像新造成腹藏發願文 誠心巳格功德斯圓廻有作之功利施無邊之種類 伏願 三界九有四生六道一切衆生同皈淨土同見彌陀同聞正法同化衆生發願巳 皈命禮 三寶慈尊 因玆奉祝 主上殿下壽萬歲 王妃殿下壽齊年 世子邸下壽千秋 國泰民安法輪轉 天龍土地護道場 佛像大施主 曺命奎 兩主 黃金大施主 金永立 兩主 黃金大施主 李唜孫 兩主 供養大施主 吳壽聖 兩主 供養大施主 金守貞 兩主 金大施主 李唜䃼 兩主 金大施主 銀花伊 兩主 烏金大施主 金哲 兩主 腹藏大施主 敬● 比丘 烏金大施主 印暉 比丘 面金施主 春月 釘主 朴孝養 兩主 助緣施主 沈立 證明雙印比丘 匠師守衍比丘 飯頭 智祥 比丘 灵澈比丘 菜頭 性澈 比丘 省敏比丘 執事 釋心 比丘 思忍比丘 行者命吉 信寬比丘 侍者海生 明惠比丘 兼別座 印天 比丘 印宗比丘 大化士 惟演 比丘 侍者夢还

숭정 12년(1636년, 인조 17) 기묘 가을과 겨울 두 절기동안, 만행산 풍국사 대웅전에 약사존상(약사여래좌상)을 새로 조성하고 복장 발원문을 적습니다. 성심이 이미 통하여 공덕이 이루어졌으니, 만들어진 공덕이 유익을 가져와 한없이 널리 퍼지기를 바라옵니다. 엎드려 바라옵나니, 삼계(三界)·구유(九有)·사생(四生)·육도(六道)의 일체중생이 함께 정토에 귀의하고, 함께 아미타불을 뵈며, 함께 정법을 듣고, 함께 중생을 교화하게 하소서. 발원을 다 마치고, 삼보와 자비로운 부처님께 예배 드립니다. 이에 삼가 축원하옵나니 주상 전하의 수명이 만세에 이르시고, 왕비 전하의 수명이 한평생에 이르시며, 세자 저하의 수명이 천추에 이르소서. 나라가 태평하고 백성이 평안하며, 법륜이 굴러가고 천룡과 토지가 도량을 지키소서. -이하 생략-