대한불교조계종 포교원의 ‘간화선 기본 교육 프로그램’은 2003년부터 연구, 개발을 시작하여 『조계종 간화선 기본 수행 프로그램 지침서』를 발간하였다. 10주의 교육과정을 진행할 수 있게 하는 지침서로 기초교리와 참선 지도로 구성되었다. 그리고 2003년부터 2005년에 걸쳐 다양한 선 수행 관련 강좌나 세미나 등이 활발하게 개최되었으며, 조계종 교육원에서는 간화선 수행 지침서인 『조계종 수행의 길-간화선』을 발간하였다. 이렇듯 2000년대 불교계는 간화선 관련 연구가 활발하게 이루어졌다. 2010년 8월에는 동국대학교 학술원에서 ‘간화선, 세계를 비추다’란 주제로 간화선 국제학술대회를 개최하였다. 이후 간화선에 대한 다양한 연구가 진행되었는데, 선을 심리치료적 관점에서 접근한 연구서로는 『선치료』, 『선수행과 심리치료』, 『선과 뇌의 향연』등이 있다. 또한 간화선 관련 심리치료적 효과나 체험에 대한 분석 관련 논문은 「선 심리치료의 방향과 그 실제-좌선, 호흡 그리고 마음 밝힘을 중심으로」, 「상담 및 치유에 대한 대승 간화선의 접근」, 「간화선 집중수행 체험의 질적분석」, 「간화선 수행체험의 심리학적 분석-안국선원 간화선의 사례를 중심으로」, 「심리치유적 관점에서 간화선의 응용모델-육도의 핵심감정 치유기제로서의 ‘화두’의 응용」, 「간화선 수행이 중,고령자의 심리적 특성(우울,불안,분노)에 미치는 효과」 등이 있다.