간화선 수행을 하게 되면 마음의 안정을 가져와 혈액순환이 원활해지고 맥박수가 떨어지는 변화가 일어난다. 참선 수행효과에 대한 의학 자료를 보면 수행 시 맥박 수뿐만 아니라 혈액이 심장에서 나가는 양도 감소되고 있다는 내용이 빈번하게 나온다. 참선 중에는 심장의 부담이 적어지고 심장에 가장 필요한 휴식을 가져온다. 이런 의미에서 심혈관이 약한 사람들은 병원치료와 더불어 참선을 통해서도 도움을 받을 수 있다. 또 참선 중에는 혈압이 정상화된다. 혈압이 약간 높은 수행자가 간화선 수행 도중 심장 확장 시에는 약 5밀리 가량, 심장 수축 시에는 약 10밀리 가량, 전체적으로 15밀리 가량 혈압이 떨어졌다는 연구가 있어 참선은 고혈압 환자들에게도 도움을 줄 수 있다고 하겠다. 국내의 성인 남녀 3인 중 한 명이 혈압이 높다고 조사결과가 있다. 고혈압은 심장마비, 발작, 뇌일혈, 기타 중요 내장 기관에 치명적인 영향을 미친다. 보통 마음의 불안정이 고혈압과 연관이 있다는 유관연구가 있다. 참선은 혈액순환을 도와 고혈압 치료와 심장병 예방 등에 유효하다. 참선 중 혈액 중의 산소 소비량과 같은 신진대사를 측정한 연구결과도 있는데, 참선 시작한 지 5분 만에 산소 소비량이 현저히 떨어지고 10분 후에는 16%까지 떨어졌다고 한다. 혈액 중의 산소와 이산화탄소의 균형이 일정하게 유지된다는 것이 연구 결과로 입증되었다. 이런 결과는 참선 중 신체가 깊은 휴식 상태에 있다는 것을 말하는 것이다. 참선 중에는 신체도 휴식을 취하고 세포가 필요로 하는 산소량이 감소하기 때문에 자연스럽게 일어나는 신체 변화라고 볼 수 있다.