좌선의 자세에는 결가부좌와 반가부좌가 있다. 가부좌는 책상다리와 유사하지만 더 안정적이다. 방석 위에 앉아서 한쪽 다리를 다른 쪽 다리 위에 올려놓는다. 이것을 반가부좌라고 한다. 결가부좌는 한쪽 다리를 허벅지에 올려놓은 채 반대쪽 다리를 그 위에 올려놓는 자세이다. 결가부좌에는 두 가지 방법이 있다. 오른쪽 다리가 안쪽에서 왼쪽 다리 위에 올려져 있으면 항마좌라고 하고, 왼쪽 다리가 안쪽에서 오른쪽 다리 위에 올려져 있으면 길상좌라 한다. 사람에 따라 다르지만 길상좌를 하는 경우가 많다.

수행시 가장 이상적인 자세는 결가부좌가 이상적 자세이지만 반가부좌를 해도 무방하다. 초보자의 경우는 결가부좌가 힘든 경우가 있으므로 반가부좌를 먼저 해서 익숙해진 후 결가부좌를 시도하는 것이 좋다. 초심자에게는 반가부좌도 힘들고 다리가 저리지만 조금 익숙해지면 나중에 자세가 편해진다. 가부좌를 하고 방석 위에 앉을 때는 방석 뒷부분, 엉덩이가 닫는 부분의 방석을 접어서 높게 한 뒤, 양 무릎이 모두 땅에 닿게 앉으면 자세가 안정되어 쉽게 발이 저리지 않는다. 최근 입식 생활로 인해 방석에 앉는 것이 불가능한 경우는 의자에 앉아서 좌선을 할 수도 있다. 이 경우 양발바닥 전체를 바닥에 붙이고 수행한다. 허리는 일직선이 되도록 자연스럽게 세운다. 허리를 세우되 힘을 주지 말고 편안해야 한다. 허리를 세우고 가슴을 펴면 훨씬 편안하고 오래 할 수 있다. 양 귀와 양 어깨가 나란히 일치하도록 하고, 코와 배꼽이 일직선이 되도록 한다. 뒤통수와 꼬리뼈 부분이 일직선이 되게끔 하고 턱을 안으로 약간 당겨준다. 머리통 전체가 천정의 끈에 매달려 있는 것처럼 자유롭게 느끼면서 몸을 길게 펴준다. 손은 오른쪽 다리가 왼쪽 다리 밑에 있으면, 그 다리를 포갠 순서에 맞추어 오른 손바닥을 배꼽 아래에 놓고, 왼손을 그 위에 얹어 양 엄지를 붙여서 둥그렇게 만든다. 발의 순서가 앞서와 반대라면 손의 순서도 발의 순서에 맞춘다. 몸을 천천히 앞과 뒤, 왼쪽과 오른쪽으로 반복해서 흔들어 몸의 중심을 잡은 뒤 허리를 바로 세우고 편안하게 한다. 입과 이는 긴장을 풀고 입술은 살짝 다문다. 혀를 말아 혓바닥 아래쪽이 입천장에 닿도록 한다. 눈은 반쯤 뜨고 부릅뜨지도 말고 감지도 말고, 자연스럽게 시선은 1~2m 앞 바닥에 둔다. 눈을 감으면 졸음이 오기 때문에 눈은 반쯤 떠야 한다. 호흡은 지극히 자연스럽게 하되 약간 깊이 들이마시고 천천히 내쉰다는 생각으로 하면서 화두를 드는 것이 좋다. 화두가 들어지면 호흡은 저절로 따라온다. 오로지 화두에만 집중하고 일체 다른 것에 신경 쓰지 말아야 한다. 오직 화두만 간절히 참구해 가면된다. 처음에는 10분 정도 해보고 나아지면 20분, 그 다음 30분, 50분 정도로 점진적으로 늘려 가면 좋다. 좌선 시간은 50분이 기본이지만 익숙해지면 차차 시간을 늘려 간다. 일반적으로 50분 좌선하고 10분 경행하여 다리를 풀어주는 것이 좋다. 이상과 같은 방법으로 좌선을 하되 스님과 같은 유경험자에게 배워서 하는 것이 좋다.