부산 해운정사는 1971년에 진제(眞際)가 창건하였다. 해운정사에는 3개의 선원이 있는데 스님들을 위한 금모선원(金毛禪院)과 재가자들을 위한 해운정사 시민선원, 토요용맹정진선원이 있다. 해운정사 시민선원은 스님들과 같은 일정의 동안거·하안거를 지내며, 100여명의 수행자들이 정진할 수 있다. 안거기간 동안에는 조실 스님의 수행점검이 이루어진다. 토요용맹정진선원은 주말 참선 프로그램을 운영하는 선원으로 매주 토요일 저녁 8시부터 다음날 새벽 2시 45분까지 참선 후 새벽예불로 마무리한다. 선원은 3층건물로 1층은 공양간으로 사용 중이며, 3층이 선원이다. 이 곳에서도 100여명의 수행자들이 정진 할 수 있다. 이 외에도 매년 음력 9월 15일부터 18일까지 3박4일간의 철야용맹정진 대법회를 통해 승속 및 종교를 초월해 모든 이들이 참선 수행을 할 수 있다.